高通量微波消解儀內的微波是通過磁控管產生的，磁控管是一種用來產生微波能的電真空器件，實質上是一個置于恒定磁場中的二極管，管內電子在相互垂直的恒定磁場和恒定電場的控制下，與高頻電磁場發生相互作用，把從恒定電場中獲得能量轉變成微波能量，從而達到產生微波的目的。微波消解儀雙磁控管排列設計，高頻閉環反饋控制等手段，可精確控制微波化學反應進程。

磁控管由密封真空管組成，管內有柱形中心陰極，置于柱形陽極筒內，電子被靜電場b吸引流至陽極，沿真空管軸的穩定磁場a使電子偏離其徑向路程，繞陰極旋轉，產生微波頻率的震蕩，產生的微波在天線的耦合作用下，將大量的微波定向傳輸到外部，震蕩產生微波會導致陽極套內會發熱，在散熱板的作用下，對陽極套導熱并風冷，進行降溫。

高通量微波消解儀雙磁控管排列方式：
1、雙磁控管安裝在爐腔后側面（側面發射微波），微波從后面向前發射。40位高通量微波消解罐分兩圈分布在轉盤上，外圈24個，內圈16個。側面發射的微波被外圈消解罐中樣品吸收，內圈樣品吸收的微波少很多，導致內圈溫度低，外圈溫度高。內圈樣品不能完全消解。
2、微波消解儀兩個磁控管安裝在爐腔頂部，微波從頂部向下發射微波，內外圈消解罐接收相同的微波，內外圈消解罐溫度安全一致，可以保證內外圈樣品的同時均勻徹底消解。